以下操作によりタスクバー上で表示しない設定が可能です。
1.まずhLauncherの無視ウインドウ設定で適当なウインドウを
追加します。 ここでは、何も登録されていない状態に
エクスプローラを追加したと仮定します。
2.hLauncherを終了します。
3.レジストリエディタで以下の値を編集します。
HKEY_CURRENT_USER\Software\Hiro's tool\hLauncher
\Filter\ClassName0
ExploreWClass → Shell_TrayWnd
4.hLauncherを起動すると、タスクバー上で表示されなくなります。
上記はそのうちGUIで行えるようにします。